进城之后,中华军接管了福州城里的控制权,然后派人以绍武朝廷的名议，通告福建的其他各地方的官员们，立刻都派人到福州来，向中华军投降。
就在第二天，郑成功首先就派人来了，表示尊照绍武朝廷的決议，率泉州府、彰州府以及部众都归顺中华军，在随后的几天里，邵武军、汀州府、福宁府等地的地方官员也都纷纷派人到福州，表示向中华军投降。而段鹏也对各地方官员进行安抚，让他们现在依照但任原职不动，治理地方，维护地方稳定，等着南京政府派遣官员来处理相关事务。
这时整个福建省己经都归属了南京政府，离中华军正式向福建发动进攻，还不到一个月的时间。而段鹏也写好报告，发回南京，请内阁立刻派遣行政官员过来，接管地方事，随后他又会见郑成功，让他继续守卫泉州、彰州两地，并且代管福州的防卫事务，而中华军则继续向广东进攻。
这次段鹏带领的部队一共有三个军，分别为江西军区第十六军，南京军区第七、二十军，和海军部第四分舰队。
进军路线由江西军区第十六军，南京军区第二十军，从福建西南出发，进攻潮州府，第七军随第四分舰队从海上出击，攻取广州，而原来驻守江西的江西军区第八军，也从赣州南部出击，进攻南雄、韶州地区、三箭齐发，攻向广东。
在广州的尚可喜这时已经得知绍武朝廷投降,福建全境失守的消息,另外广西那一边,永历朝廷虽然还没有完全灭亡，但桂林、柳州二府也都相继被中华军攻破，朱由榔君臣人等也向西逃到了贵州省。广东实际己经完全被中华军三面包围，而另一侧是茫茫大海，根本就无路可逃，而且连个救军都求不到。
这时尚可喜也不由得又惊又怕，虽然说知道中华军的战斗力强，但也没有想到，南明各朝会这么不堪一击，中华军的进攻，简直就是势如破竹一样。这才几天的功夫，广东、福建就都完了。由其是福建的绍武朝廷，根本没怎么抵抗，就举手投降了。尚可喜气得真想破口大骂，这也太没有用了，好歹也该死守福州，背城一战吧
尚可喜当然知道，别人向中华军投降，包括在广州的永安朝廷君臣，都有可能在投降之后还能保得住活命，但只有自己，很难逃得过这一劫。一来中华军是靠极积抗清积累下了强大的声望，而尽量自己在三年多以前己经宣告了反正，并且扶植明室的藩余鲁王朱以海为帝，建立了永安朝廷。
但自己的这点老底自己清楚，自己本来就是弃明降清的叛臣，在清廷的两次南征中,都是清军的主力干将,当初在广东反正，完全是迫于形势，不得以而为之，而且在反正之后，还一直和清廷有来往联糸，虽然说这一点是私密行事，也许并没有人知道。但自己反正的动机不纯，这是人所皆知的事情，在永安朝廷就有不少官员都经常拿这一点说事，攻击自己。从南京政府对自己的态度也明显比其他两个朝廷要差一些，也能看得出来，商毅对自己显然没有好感。
而且这次三个南明朝廷闹联盟，共同对抗南京，虽然说是大势所趋，但最初发动联盟的人却是自已,因此自己投降中华军，绝不会有好结果，那怕现在不会对付自己，但也逃不过秋后算帐，因此自己也没有别的退路可走，只能在广东和中华军决一死战。
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